近年来，新疆法院坚持以习近平生态文明思想为指导，深入贯彻“两山”理念和生态环境司法保护工作座谈会精神，以改革创新为动力，推进环境审判制度体系和审判能力现代化，努力提升环境资源审判工作质效，为打好污染防治攻坚战、助力大美新疆建设提供了有力的司法服务和保障。
推进环境资源案件集中管辖
根据辖区生态环境功能区建设和生态环境保护要求，完善环境资源专门化审判机制，推进环境资源刑事、民事、行政案件由铁路法院集中管辖，环境民事公益诉讼案件分别由自治区高级人民法院伊犁州分院、阿克苏地区中级人民法院和乌鲁木齐铁路运输两级法院管辖。坚持专业化审判道路，着力打造一支秉持现代环境司法理念、既精通法律又熟悉环境资源专业知识的高素质法官队伍，截止目前，共设立2个环境资源审判庭，1个环境资源人民法庭，60个环境资源专业合议庭，3个专门环境资源审判团队。2020年，共受理各类环境资源案件9215件，其中刑事案件388件、民事案8810件、行政案件17件，审理环境公益诉讼案件55件。
加强与有关部门协调联动
自治区高院与检察机关建立信息互通、培训共通的联动机制，加强对公益诉讼案件的办案指导，进一步规范办案流程。与生态环境厅等14家单位联合印发《自治区生态损害赔偿监督办法（试行）》，妥善审理碳排放、能源节约、草场破坏、退耕还林等与气候变化应对密切相关的案件，推动形成环境资源保护合力，构建打击违法犯罪、保护生态环境的联动工作新模式、新体系。
深化案件监督和对下指导
通过建立重大案件报告和环境公益诉讼、生态损害赔偿案件逐级层报制度，将环境公益类诉讼、生态环境损害赔偿诉讼、在辖区内关注度较高或涉众环境资源类案件，纳入院庭长监管“四类案件”，全程留痕、全程监管。深入环境资源案件高发地区，调查生态环境受损情况、案发历史、破坏原因和修复所需各项经济成本，现场解答办案疑难问题，形成规范性意见，指导各级法院环境公益诉讼审判实践。多形式多平台多渠道开展保护生态环境宣传活动，邀请人大代表、政协委员旁听庭审，依托“法官工作站”“法官工作室”平台与群众进行互动交流，扩大环境资源司法保护效果，提升公民生态环境保护意识。